S1 Administrasi Rumah Sakit dalam menunjang proses belajar mengajar menjalin kerjasama dengan berbagai instansi kesehatan dan pendidikan baik didalam maupun luar negeri, hal ini dilakukan agar tercapainya visi misi prodi dan profil lulusan prodi S1 Administrasi Rumah Sakit :
S1 Administrasi Rumah Sakit Universitas Alma Ata Yogyakarta, menjalin kerjasama dengan Intansi Dalam Negeri sebagai berikut :
- RSUP Dr. Sardjito Yogyakarta
- RSPAU dr. S. Hardjolukito Yogyakarta
- RSUD Wates Kabupaten Kulonprogo
- RSUD Dr. Soedirman Kebumen
- RS Islam Nahdlatul Ulama (RSI NU) Demak
- RSUD Wonosari
- RSJD Dr. RM. Soedjarwadi (Klaten) Provinsi Jawa tengah
- RSUD Sleman
- RSIA Fajar Yogyakarta
- Fakultas Kedokteran UII Yogyakarta
- Directory Of Open Access Journals (DOAJ) dan Perkumpulan Ahli dan Dosen Republik Indonesia (ADRI)